该实验室建设严格按照国家卫健委《医疗机构临床基因扩增管理办法》的标准建设了试剂配制区、样本提取区、核酸扩增区，配备了实时荧光PCR分析仪、核酸提取仪、生物安全柜、医用超净工作台、高压灭菌器等重要设备。为保证检测结果的准确性，前期已进行仪器与检测试剂性能验证，实验室配备了强大的人员力量，其中包括主任技师1名、副主任技师1名、主管检验师8名，除每批测定进行室内质量控制外，同时也定期参加四川省临床检验中心室间质量控制，检验质量全程有保证。
该院分子生物学检测实验室始建于2017年，该实验室的建立填补了崇州地区分子检测技术的空白。今年6月30日又建成了崇州地区首家独立P2+的分子实验室，专门用于新型冠状病毒核酸检测。目前，医院拥有2个分子生物学检测实验室，是崇州地区唯一一家拥有新型冠状病毒核酸检测能力的医疗机构。新型冠状病毒核酸检测实验室的建立，大大增强了当地医疗应急检测能力及技术储备，在应急情况下，最快可在采样后6小时出具报告。
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