《方案》围绕构建“市-县（区）-基层”医疗卫生机构有序衔接的重大疫情救治体系总体要求，提出了实施疾病防控救治、科研检验检测、重症医疗救治、紧急医学救援、基层预防控制、中医药防控救治等六大能力提升工程。将建设由自贡市公共卫生临床中心和四区两县重大疫情防控救治基地共同构建的公共卫生临床救治体系，增强快速反应能力。推进自贡市疾控中心专家工作站、国家致病菌网络自贡实验室、传染病预防控制国家重点实验室新发传染病自贡研究基地、复旦大学结核病研究基地、人兽共患病防治研究院等平台建设，创建川南区域卫生应急检测检验中心，提升疾病防治科研和转化应用能力。推动建立应对突发公共卫生事件指挥调度系统、医疗急诊急救系统和重大疫情防控救治能力培训基地。
此外，《方案》还围绕疾病防控救治保障制度，提出加强完善公共卫生法治建设、科研管理服务、公共卫生人才供给、应急物资保障、医疗保险和救助制度、中西医高效协同等六个方面机制建设。将调整完善公共卫生安全应急管理、传染病防治、突发公共卫生事件等规范性文件和应急预案。建立完善科研攻关协同推进机制，培育临床医学、公共卫生等领域科研能力。完善全科医学、公共卫生人才培养等制度，加强公共卫生人员待遇保障、考核评价和激励。优化全市重要应急物资特别是医用物资产能布局和技术储备，构建市、县两级联动的应急物资储备保障格局。完善重大疫情医疗救治费用保障机制，探索建立特殊群体、特定疾病医药费豁免制度，增强医疗救助托底保障功能。传承创新发展中医药，健全中医药参与重大疫情响应机制。
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